En 1530, al hacer la conquista de Tonalá, Nuño de Guzmán también conquisto Tlajomulco.
El nombre de Tlajomulco se deriva de los vocablos tlalli (tierra), xomulli (rincón) y co (lugar), y se traduce como “Lugar escondido”. Otros nahuatlatos afirman que se origina de los vocablos “tlaxomúlli” (rincón o esquina) y “co” (lugar) por lo que se interpreta como “en el rincón” o “tierra e el rincón”.
